小兰的朋友原子家铃木财团准备展出他们家珍藏的沙皇尼古拉二世家的宝物——回忆之卵，回忆之卵里收藏了沙皇尼古拉二世一家的珍贵照片，由此特别珍贵岂料在展出之前，却收到了怪盗基德的通知函，上面用迷语的方式列明他盗宝的时间。原子找到小兰的爸爸名侦探毛利小五郎帮忙，当然，真正的幕后高手柯南也会和小兰一起前来。柯南遇到了同为侦探的服部平次，两人决定一起联手解开怪盗基德之谜！...

柯南在街头目睹一名正打电话的警察在雨中被射杀，忙将凶手追踪，但凶手逃脱死者闭眼一刻紧抓左胸，似乎有所暗示。事后柯南从目暮警官口中了解到紧抓左胸是暗示那里有警察手册。不久又有警察手拿警察手册被人射杀于地下车库。对于这两起案件，目暮警官等人一反常态不愿向毛利小五郎及柯南透露太多信息。毛利不甘心进一步追问，白鸟警官只答一句“Need not to know”。该话是警察之间所用的密语，意味这两起杀人事件...

柯南、灰原及少年侦探队成员步美、光彦、元太随博士这日露营完毕，绕道参观西多摩市新建于富士山前的日本第一双塔摩天大楼，毛利小五郎恰也应双塔所有者、他的学妹常盘美绪之邀，携小兰、园子参加开幕典礼美绪介绍下，他们认识以画富士山闻名的画师如月峰水、市议员大木岩松、双塔的设计者风间英彦（森谷帝二的弟子，第一弹《引爆摩天楼》中，森谷曾向新一挑战）、天才程序员原。期间灰原的举动异常。 大木提前入住B塔被害，目暮...

这日柯南、小兰一行人来到米花市市政大厅，一场有关最新游戏“茧”的发布会正在这里召开由于迥异于以往任何一款游戏的“茧”可能一举改变全球游戏业界的价值观，发布会吸引了代表日本上流社会的政治、财经、演艺界人士，50名游戏体验者也多是他们的后代，新一的父亲、推理小说大师工藤优作由于参与故事编写，也来到现场。这边热热闹闹，游戏的研发者兼负责人坚村却被杀于地下室。坚村死前留在键盘J、T、R上的血迹令柯南想到答...

知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”毛利小五郎遭到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。 令柯南吃惊的是，基德竟扮成工藤新一出现在众人面前，但他及众人方向不同的紧张过后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道...

概要 史东那城市四处都有因魔力而动的魔偶，在这里的两位伯爵海建与葛拉尼欧正在争夺城镇的主导权於是两人达成协议要以魔偶对决来决定一切。生在魔偶工匠家族的不幸少女莱雅，因家中父兄两人的不合而伤透脑筋。其父兄两人也莫名地卷入这场城主之争，并且竟然做出莉娜和娜卡的魔偶！究竟史东那城市真正的未来与和平是否真的会到来呢？...

莉娜和娜卡正優閒自在地在可爾多倫城市內享受美食，一群龍之集團突然出現在她們的面前率領龍之集團的美少女瑪蕾妮和可爾多倫的士兵們展開對決，莉娜她們就這麼不知所以然地被捲入這場騷動。不過，龍之軍團卻在莉娜要施展攻擊魔法時全數逃之夭夭。卡伯特城的領主卡伯特召見她，並述說事件的起因。因為看到莉娜的身手如此厲害，便拜託她幫忙，只要將其愛女瑪蕾妮帶回，就付賞金200枚金幣。但其實這一次騷動的原因是他的女兒要求提...

概要 只要是有美味佳肴的地方，就一定会出现一位自称美少女天才魔导士的莉娜，和一位自称是其保护者的高里一如往常地来到以盛产章鱼闻名的海边城市，想说只需帮忙捕鱼便可免费享用章鱼美食；却因莉娜太过於热衷捕鱼，造成不只鱼群所在处，甚至连船只都遭受破坏，最後能享遭到章鱼美食的只有高里……。不过这却是整个恐怖事件的起源！一食用章鱼的人就会得到所谓「只会说章鱼话」的怪病，因而高里也被传染了。但是事件演变到没吃章...

概要 莉娜与娜卡的面前突然出现一位泪汪汪的美少女她的名字叫莎琳娜，十天前她所居住的比亚兹村落，被一个名为塔因的秘密组织所驱使的下级恶魔占领，她是来请求她们帮忙，并且述说恶党们还胁迫村人去做一些挖掘的工作。平常要是没有酬劳，莉娜是不会接受委托的。不过她却突然想起在比亚兹村落有著＂妖精之传说＂，便接下了此次的任务。 从本作开始，「用拖鞋殴打娜卡」和「在结尾争夺钱币」的片段剧情在剧场版中变成惯例。...

很久很久以前，在原始的混沌之海中，从无边的黑暗中诞生了唯一一个纯真的意志。这个意志所产生的力量，让原本一片虛无的混沌之海发生变化。...